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S4 F19: Am 36. Tag der Anti-Wall-Street-Proteste explodiert auf der Boylan Plaza inmitten der Demonstranten eine Bombe. Fünf Tote und viele Verletzte sind das Ergebnis dieses feigen Anschlags und FBI und Heimatschutz übernehmen die Zuständigkeit bei den Ermittlungen. Das NYPD darf zunächst nur Zeugen befragen und muss alle Resultate seiner Arbeit mit dem FBI abstimmen. Nach über 100 Zeugenaussagen kommen Beckett, Castle und das Team jedoch erst weiter, als Captain Gates die GPS Daten aller Handynutzer auf der Boylan Plaza erhält, und sie daraufhin Bewegungsprofile erstellen können. Andrew Haynes, der zunächst Hauptverdächtigte, wird ans FBI überstellt, aber kurz darauf müssen Beckett und Castle feststellen, dass das FBI den Falschen hat, denn ein glaubwürdiger Zeuge entlastet ihn und belastet jemand anderen. Als Beckett diesen jungen Mann verhört, erfährt Castle unbeabsichtigt, dass sie sich an alles erinnert, was sich damals beim Mordanschlag auf sie zugetragen hat. Castle ist schockiert und beschließt, Konsequenzen daraus zu ziehen, was aber nicht heißt, dass er seine Zusammenarbeit mit Beckett beenden will. Trotz der Missstimmung gelingt es ihnen, den bzw. die wahren Täter ausfindig zu machen, die den Anschlag nur aus Karrieregründen ausgeführt haben.