Der unsterbliche Apocalypse ist der älteste und mächtigste Mutant der Welt, der allererste Homo sapiens superior. Nach Tausenden von Jahren ist er aus einem tiefen Schlaf erwacht und schickt sich an, Menschen wie Mutanten gleichermaßen zu unterjochen. Um seinen Plan einer neuen Weltordnung zu verwirklichen, bringt er mächtige Mutanten wie den desillusionierten Magneto unter seine Kontrolle. Professor X und Raven führen ein Team junger X-Men an, um die Welt vor dieser Bedrohung zu retten.