Arpeggio of Blue Steel

Im Verlauf des 21. Jahrhunderts hat die Menschheit durch den in Folge der globalen Erderwärmung ansteigenden Meeresspiegel einen großen Teil der Landmasse verloren. Wie vom einsetzenden Chaos gerufen, tauchte plötzlich die Nebelflotte auf und beanspruchte die Herrschaft über die Hochsee. Die Menschheit scheint zu einem langsamen, qualvollen Tod verdammt zu sein.

Gunzou, der Kapitän von I-401, nimmt in Folge einer Mission von der japanischen Regierung Kurs auf Yososuka. Doch Takao, eine Flotte schwerer Kreuzer der Nebelflotte, stellt sich ihm in den Weg. Als Takao nach und nach das Ablenkungsmanöver vernichtet und auch das Schiff selbst bedroht, beschließt Gunzou, dass eine Konfrontation unausweichlich ist.

Nach dem Sieg über Takao erreicht I-401 den Hafen von Yososuke, um dort eine Probe eines streng geheimen, von der japanischen Regierung entwickelten Sprengkopfs in Empfang zu nehmen. Doch ein mächtiger Politiker verlangt, dass Yona wieder in Regierungsgewahrsam übergeben wird. Während die Anspannung steigt, wird Yososuke plötzlich das Ziel eines Kanonenangriffs.

Im Jahre 2039 tauchen plötzlich auf den Weltmeeren mysteriöse Kriegsschiffe auf, die mit äußerst fortschrittlicher Technologie ausgerüstet sind. Die sogenannte Nebelflotte verhängt eine Seeblockade und hinterlässt eine Schneise der Zerstörung: In den folgenden Jahren kommt der weltweite Schiffsverkehr komplett zum Erliegen. Siebzehn Jahre später nehmen Gunzou Chihaya und seine Crew den Kampf auf: Mithilfe der I-401, einem U-Boot der Nebelflotte, das mitsamt seiner Personifikation, Iona, übergelaufen ist, beginnen sie die Nebelflotte zu bekämpfen.

Von I-401 besiegt, schafft es Haruna, ihre Mental-Model-Form wiederzuerlangen, aber von Kirishima hat nur der Union Core überlebt. Ein mysteriöses Mädchen namens Osakabe Makie nimmt sie bei sich auf. Sie finden heraus, dass Makies Vater der Entwickler des Vibrations-Sprengkopfs ist und entschließen sich, einen Blick auf seine Unterlagen zu werfen, aber...

Haruna und Kirishima werden von Dr. Osakabe gebeten, sich mit Makie anzufreunden. Doch aus Angst, Makie könnte in die Hände der Nebelflotte fallen, ordnet Assistenzsekretärin Kamikage einen Angriff der Spezialstreitkräfte an. Haruna versucht, Makie zu beschützen, aber ihre junge Freundschaft gerät in Gefahr als Makie von Harunas wahrer Natur erfährt...