Der totgeglaubte Spezialagent Phil Coulson (Clark Gregg) wurde wiederbelebt. Nun soll er im Auftrag der Organisation S.H.I.E.L.D. eine Elite-Truppe zusammenstellen, die überall auf der Welt ungewöhnlichen Phänomenen auf den Grund geht. In ihrem ersten Fall stoßen die hochqualifizierten Agenten auf einen Mann namens Mike Peterson (J. August Richards), der plötzlich zu einem Superhelden mit enormer Sprungkraft mutiert ist. Während der Verfolgung gerät das Team mit der cleveren Computer-Hackerin Skye (Chloe Bennet) aneinander.
