El Ministerio envía en una misión a una patrulla formada por miembros recién reclutados. El objetivo es evitar que asesinen a El Empecinado, un hombre clave en la derrota del ejército napoleónico en la Guerra de Independencia.

1588: Lope de Vega y la Armada Invencible. La patrulla viaja a la Lisboa de 1588 para evitar que Lope de Vega embarque en un navío donde encontrará la muerte segura, antes de escribir sus mejores obras.

1940: Himmler en el Monasterio de Montserrat. Durante la cita de Hendaya entre Hitler y Franco, Himmler quiere usar una puerta en el Monasterio de Montserrat para reescribir la Historia en su propio beneficio. El Ministerio deberá evitarlo a toda costa.

1491: Torquemada e Isabel la Católica, fundadora del Ministerio. La patrulla deberá viajar a 1491 para salvar de la hoguera a Abraham Levi, creador del Libro de las Puertas. En esta misión, descubrirán quién es Torquemada.

1981: El contrato del Guernica. El Guernica, tras duras negociaciones, vino a España en el año 1981 como símbolo de la vuelta de la democracia a nuestro país. Sin embargo, ciertas interferencias ponen en peligro la llegada del cuadro a España.

La patrulla viaja a la época de la Castilla precomunera para detener a un estafador. Para ello contarán con la ayuda de un joven que dice llamarse Lázaro de Tormes.