Toujours considérés comme des monstres par une société qui les rejette, les mutants sont une nouvelle fois au centre des débats. Un crime effroyable vient d'être commis par l'un deux, qui relance la polémique autour de l'acte d'enregistrement des mutants et le mouvement anti-mutants, dirigé par William Stryker. Quand ce dernier lance une attaque contre l'école de mutants du Professeur Charles Xavier, les X-Men se préparent à une guerre sans merci pour leur survie.