Un avion atterit à New York avec tous les passagers à bord décédé. Le Dr Ephraim Goodweather, à la tête du Projet Canary du centre de prévention et de contrôle des maladies et son équipe sont appelés pour enquêter.
Les quatre survivants ont des symptômes étranges, mais Eph et Nora se trouvent face à une campagne de désinformation. Setrakian, en prison, reçoit la visite d'un très vieil ami.
Eph et Nora se battent pour sauver la vie du capitaine Redfern avant de se trouver nez-à-nez avec les terribles effets du virus.
Une autopsie secrète montre la progression du virus, et Jim fait une confession surprenante. Eph et Nora cherchent le père de la plus jeune des victimes, mais quelqu'un les devance.
Avec le départ de Nora, Eph s'allie à Setrakian pour obtenir la quarantaine généralisée. Fet trouve l'inattendu, et une urgence médicale menace le plan de Palmer.
Après avoir averti Kelly de quitter la ville avec Zack avant l'expansion de l'épidémie ne continue, Eph est arrêté par le FBI.
Corey Stoll
Dr. Ephraim Goodweather
David Bradley
Professor Abraham Setrakian
Kevin Durand
Vasiliy Fet
Mía Maestro
Dr. Nora Martinez
Richard Sammel
Thomas Eichhorst
