Pour que sa dynastie ne soit pas renversée, le shogun Yoshinobu décide d'avoir recours à un trésor légendaire qui permettrait de contrôler le temps. Mais c'est sans compter sur l'intervention de Shinsaku Takasugi, guerrier d'un clan rebelle, qui va tout faire pour lui mettre des bâtons dans les roues...

Shinsaku rencontre le maître de la forteresse Susano et en apprend beaucoup sur les motivations de ceux qui ont dérobé la montre. Pendant ce temps, Susumu tente de retrouver Yoshinobu, le dernier shogun Tokugawa qui a disparu à l'avènement du nouveau shogunat.

Shinsaku retrouve Katsura et un vieil ami, Ryôma Sakamoto. Les deux hommes veulent remettre le Japon sur pied, mais Shinsaku s'offusque quand Ryôma dit vouloir utiliser le voyage temporel comme Mugensai pour parvenir à ses fins.

Afin de libérer les habitants de Kyoto des automates qui déclenchent les canons, Katsura s'infiltre dans la Brigade shogunale...

La forteresse s'agite lorsque Sakamoto, Izô et Shinsaku s'y infiltrent. Katsura va tenter de protéger tant bien que mal son secret et Shinsaku va faire une rencontre importante.

Shinsaku et Katsura peinent à trouver du métal de qualité pour leur plan. Mugensai décide d'éliminer Yoshinobu par l'intermédiaire de l'un de ses généraux.