Après avoir quitté sa maison de Paldea, Liko se rend à Kanto pour s’inscrire à l’Académie Indigo et devenir Dresseuse Pokémon. Elle est nerveuse mais aussi impatiente d’apprendre de nouvelles choses sur elle et sur le monde. Après que Liko rencontre sa colocataire, Anne, les deux filles reçoivent leur partenaire Pokémon : Anne est ravie d’avoir Moustillon, mais Liko semble déçue de découvrir que son partenaire est Poussacha, un Pokémon de Paldea. Pourtant, Liko tente de se lier d’amitié avec le Pokémon, et ils finissent par établir une relation. Mais un jour, un jeune homme mystérieux s’approche de Liko, prétendant avoir une lettre de sa grand-mère. Il semble aussi s’intéresser au pendentif de Liko, mais Liko se méfie...
Liko et Poussacha continuent de fuir Amethio, mais quand Friede débarque avec son Dracaufeu, Amethio est forcé d’interrompre la poursuite pour se battre. Pendant le combat, Liko est presque frappée par une attaque, mais son pendentif l’entoure soudain d’une barrière protectrice. À l’intérieur, Liko est choquée de voir un Pokémon inconnu, mais il revient rapidement dans le pendentif. Liko et Poussacha tombent, mais Friede et Dracaufeu les attrapent et les emmènent dans le Brave d'Oliville, un dirigeable qui abrite les Électacleurs Volants. Liko a beaucoup de questions, mais pas le temps de les poser. Amethio est de retour, Friede fait alors appel à un partenaire puissant : le capitaine Pikachu !
Après que les Explorateurs ont enlevé Poussacha, Liko se réveille à bord du Brave d’Oliville pour découvrir que Friede est à la recherche des bandits. Mais il a perdu leur piste et Liko insiste pour continuer seule les recherches. Friede rejette son plan, révélant que sa mère a demandé aux Électacleurs Volants de la protéger. Le Rocabot de Murdoch essaie de retrouver la piste de Poussacha pendant que Liko et Mollie font des courses. Soudain, Liko entend Rocabot aboyer après quelqu’un qui les mène directement aux Explorateurs... et à Poussacha ! Alors que Friede et Amethio reprennent le combat, Liko et Poussacha profitent de la diversion et s’évadent. Certaine que les Électacleurs Volants sont de bonnes personnes, et voulant des réponses à ses questions, Liko leur fait une demande...
Maintenant membre des Électacleurs Volants, Liko fait le guet, mais le Brave d’Oliville doit s’arrêter sur une île pour des réparations. Bientôt, Liko remarque que Chochodile a disparu et réalise qu’il a dû tomber du dirigeable. Elle part à sa recherche avec sa Poussacha, mais elles sont poursuivies par des Pokémon sauvages qui sont en colère parce que Chochodile a mangé leur nourriture. Pendant ce temps, Chochodile rencontre Rhod, un garçon qui vit sur l’île et rêve de devenir Dresseur Pokémon. Finalement, Rhod et Chochodile rencontrent Liko, mais les Pokémon sauvages sont toujours en colère. Friede et Capitaine Pikachu arrivent alors à la rescousse. Les Électacleurs Volants font leurs adieux à Rhod, mais le garçon a des regrets...
Pour voir Chochodile, Rhod se faufile à bord du Brave d’Oliville, mais les Électacleurs Volants le découvrent ! Ils l’autorisent à rester, mais Liko et lui ne parviennent pas à trouver Chochodile. Le lendemain, le dirigeable doit à nouveau atterrir pour des réparations, et Rhod suggère de demander de l’aide à son grand-père. Pendant ce temps, Chochodile se précipite sur l’île à la recherche de Rhod, mais il voit les Explorateurs approcher ! Il trouve Rhod, et tout le monde retourne au Brave d’Oliville pour combattre les Explorateurs tandis que les Pokémon sauvages de l’île font les réparations. Lorsque c’est au tour de Rhod et Chochodile de combattre, Chochodile a du mal à attaquer. Rhod trouvera-t-il un moyen de l’encourager ?
Amethio manque Liko de peu, mais son pendentif l’entoure à nouveau d’une barrière — et étrangement, la Poké Ball ancienne de Rhod se met simultanément à briller. Tous trois commencent à se battre, mais Amethio a le dessus, et Liko demande de l’aide. Soudain, le pendentif et la Poké Ball ancienne s’illuminent, et un Rayquaza noir émerge de la Poké Ball ancienne. Il fait fuir les Explorateurs puis s’envole. Plus tard, le grand-père de Rhod explique que le Pokémon est mentionné dans une légende impliquant un aventurier du passé, et Rhod décide de devenir officiellement un Dresseur Pokémon avec Chochodile pour partenaire. Mais quand il sera temps pour les Électacleurs Volants de partir, se joindra-t-il à eux ?
Minori Suzuki
Liko
Yuka Terasaki
Roy
Taku Yashiro
Friede
Ikue Ohtani
Captain Pikachu
Ayane Sakura
Orio