Ｄｒ．ＳＴＯＮＥ

擁有超人頭腦的科學少年千空和體力超群，性情卻率真善良的好友大樹。對青梅竹馬杠長年單相思的大樹，縱使一直被千空嘲笑，也終於鼓起勇氣要向杠告白。然而，天空中突然出現耀眼的光芒，全世界的人類在一瞬間被「石化」的神秘現象發生了！從那之後過了大約3700年——在文明消失殆盡的「石之世界」中，千空從石化中解放並與大樹再會，決心從零開始創造文明！

某天，全世界的人類都在一瞬間被石化的神秘現象發生了……！在3700年後的世界甦醒的千空和大樹，在文明完全消失的石之世界不斷進行實驗，終於完成了解除石化的「復活液」。兩人想復活青梅竹馬杠，卻遭遇了意想不到的緊急事件。在危急關頭下，他們只好將昔日被喻為靈長類最強的高中生——獅子王司復活！究竟司的復活會為他們帶來好處還是壞處？

千空和大樹利用完成的復活液解開了靈長類最強高中生——獅子王司的石化。然而，司卻向千空表達「僅復活純真的年輕人，淨化人類」的過激思想，並開始破壞被石化的大人們。感到危險的千空決定復活青梅竹馬杠，並讓他們來決定是讓大樹和杠先逃走，還是三人一起留下阻止司繼續破壞。就在這時，回到營地的司絲毫不隱藏自己的殺氣，向千空等人逼近……！

離開了司的千空三人來到箱根。為了和擁有最強戰鬥力的司對抗，千空需要獲得火藥。他們在箱根收集了必要的材料，並急忙開始製作火藥。在這時候，千空等人發現了遠處升起的狼煙！千空確信在這石之世界裡，除了自己以外還存在其他人類。為了令其他人類察覺到他們的存在，他冒著被司發現的風險，依舊堅持發出信號，但是……！？

千空等人在箱根的森林中發現遠處升起狼煙。但是在與升起狼煙的人見面之前，就被趕來的司發現了。杠被抓作人質，而作為拯救人質的條件，司要求千空把把復活液的配方告訴他。為了拯救人質，千空只能照做。其後司為了達成自己的理想，強迫千空放棄科學，千空卻因為不能接受這項交易而被司殺害。悲憤交加的大樹和杠心懷與千空「共同戰鬥」的約定，向司發起挑戰！

人類被石化後已經過了數千年。突然在某一天，千空獨自一人從石化中甦醒，他開始在文明滅亡的世界中求生。光是確保最低限度的衣食住，體力就已到達極限的千空找到了體力無限的好友，大樹的石像並嘗試復活他。而現在則是反過來——大樹和杠抱著被司殺害的千空，也一樣堅信著和千空的約定，嘗試復活千空。到底他們可以成功嗎？