Giratina es el Pokémon robado que vive en el Mundo Inverso, un reino poco conocido junto al nuestro. Furioso cuando Palkia y Dialga perturban el tiempo y el espacio, este arrastra a Dialga al Mundo Inverso para tener una batalla, pero el conflicto es interrumpido por Shaymin, ¡el Pokémon Gratitud! Tras salir del Mundo Inverso y conocer a Ash y a sus amigos, Shaymin (comunicándose telepáticamente) pide ayuda para reunirse con el otro Shaymin en el jardín Gracídea. Después de que Ash y sus amigos aceptan ayudar a Shaymin, son arrastrados al Mundo Inverso y conocen a Newton Graceland, quien ha investigado el misterioso reino. No imaginan es que el asistente de Newton, Zero, quiere emplear el poder de Giratina para dominar al Mundo Inverso, ¡incluso si eso significa destruir al mundo real! ¿Podrán nuestros héroes y sus Pokémon frustrar los planes de Zero y proteger ambos mundos? ¿Podrá Giratina resolver sus diferencias con Dialga? ¿Qué aprenderán Ash y sus amigos sobre Shaymin?