J.D., ora medico strutturato, deve gestire i propri tirocinanti. Turk ha dei dubbi sul fatto di avere figli e cerca di impedire a Carla di restare incinta. Elliot fatica ad ambientarsi al County Hospital.
J.D. vuole dimostrare a Cox e Kelso come trattare i tirocinanti. All'ospedale, tutti evitano Jordan, che viene imbrogliata da Sam il tossicodipendente. La borsa di studio di Elliot viene revocata e la dottoressa si confida con la pettegola Carla.
J.D. trova l'elenco di cose che voleva fare prima di compiere 30 anni e si iscrive a una gara di triathlon. Elliot scopre un lato di Jake che la terrorizza e Turk cerca di fare buona impressione sui suoi capi.
A J.D. viene chiesto di presentare Kelso a una cena di premiazione. I pazienti di Kelso e Cox devono entrambi ricevere una cura sperimentale. Carla e Turk cercano di aiutare Elliot a riavere il suo vecchio lavoro, mentre l'inserviente deride J.D.
J.D. confonde l'appagamento di una donna anziana con il desiderio di interrompere le cure per una malattia terminale. Turk e Elliot faticano a trovare la causa del dolore di un paziente, mentre Carla cerca di organizzare la foto di gruppo annuale.
In un omaggio a "Il mago di Oz", J.D. tenta di tornare a casa, Turk cerca un donatore di cuore, Carla si preoccupa di non avere il coraggio di diventare madre, mentre Elliot non si ritiene abbastanza intelligente per condurre un seminario.
Zach Braff
Dr. John "J.D." Dorian
Donald Faison
Dr. Chris Turk
Sarah Chalke
Dr. Elliott Reid
Judy Reyes
Nurse Carla Espinosa
John C. McGinley
Dr. Perry Cox