アレックスはこの陰謀にシェルビーが加担しているとにらみ、姿を探していた。ところが、突然そのシェルビーが堂々と目の前に現れた! 問い詰めるアレックス。すると、シェルビーは周りに気づかれないよう何かのサインを発し始めた…。果たしてシェルビーは敵なのか味方なのか?【現在】のクワンティコでは配属先を選ぶ大詰めの研修が行われていた。アレックスはエリートコースの人質救出チームに選ばれるが、訓練では危険にさらされるハメに。
無実の罪で刑務所で服役している男を釈放させるために、ハーヴィーは新任検事に掛け合いに行くが拒絶される。検事にとって重要なのは、正義よりも検事局の体面を保つことらしい。
元外務大臣首席補佐官シンシアが加わった新生チーム。エリックとシンシアは出張の途中、エリックの娘のイーヴィーを送るためバンクーバー行きの飛行機に乗る。しばらくすると、機長がコックピットから追い出されていた。副操縦士が飛行機を乗っ取り、乗客を巻き込んで飛行機を墜落させようとしているのだ。エリックとシンシアはその目的を探り、かたくなな彼の心を開こうとする。地上にいるオリヴァーとザラが副操縦士の過去を調べると、乗客のひとりが深く関わっていることが分かり......。
