歌手を目指していた青年の遺体が田舎道で見つかり、ブレナンとブースが捜査に乗り出す。そして、ファンもいればライバルもいた被害者トミーにつきまとっていた思い込みの激しい一人の女性は、彼の死後、ストーカー行為の矛先をブースに向けてくる。
子供の頃、レナードとシェルドンはプロトン教授による科学の実験番組が大好きだった。シェルドンは、そのプロトン教授をパーティーやイベントに呼べることをインターネットで知り、家に来てもらえるよう依頼する。当日、教授が時間になっても現れず心配していると…。
海兵隊員が不可解な遺体となって発見され、チームは捜査を進める。一方、復帰を望むジヴァを快く受け入れられないギブスは、過去のある事件を振り返る。
鉄道会社の車両基地で警備員が殺された。国家安全保障上の問題に発展する可能性があるためNCISが捜査に乗り出す。事故を起こしマリファナの陽性反応が出て解雇されたことを不服とした鉄道技師が会社を訴えると騒ぎ立てていたという。有毒ガスが積まれた貨物列車が強奪され住宅地を暴走する。
ホレイショ、スピードル、カリーが木に縛られた状態で発見された、奇妙で常識はずれな大学教授の殺人事件の証拠品をひとつひとつ洗っていく。