囚人のヌート・ガンレイ総督を法廷へ護送するアソーカ・タノとジェダイ・マスターのルミナーラ・アンドゥリ。だが彼らはドゥークー伯爵の腹心アサージ・ヴェントレスが、囚人の奪還とジェダイ抹殺のために放たれたことを知らなかった。
ゾーイはライトマン・グループに、法定強姦で訴えられているカレッジフットボールの花形選手の弁護協力を求める。一方、フォスターとローカーはある宗教施設が極悪なカルトなのかどうかを確かめに施設を訪れる。
父親を殺害された米海軍特殊部隊のスティーヴ･マクギャレットは、ハワイ州知事に誘われ、犯罪撲滅のための特別捜査チームを率いる。メンバーはハワイに来たばかりのダニー･ウィリアムズ刑事、マクギャレットの父親の元同僚チン･ホー･ケリー、そしてサーファーから警官へ転身した新人コノ･カラカウア。
知事殺しの容疑で拘置されたマクギャレットのもとに、意外な人物が面会に来る。それはマクギャレットが師と仰ぐ、亡き父親の親友でもあったジョー･ホワイト少佐 (テリー･オクィン) であった。
ダニーが拉致され拷問されるが、黒幕はスティーブの母親の暗号文を狙うウォー･ファットの妻だった。そしてスティーヴは、父親が10年前調べていた件の真相を遂に突き止め、10シーズン続いた「HAWAII FIVE-0」シリーズの最終回を締めくくる。
