1988年、コロラド州ブロンソン･スプリングで夢と希望を未来へ託したタイムカプセルが埋められた。25年後の2013年、タイムカプセルの中から23歳のウェイド･バークの切断された頭部が出てきた。その2日後、もうひとつの斬首事件が発生。被害者は62歳の元保安官補チャーリーだ。検視の結果、2つの遺体には同じノコギリが使われていたことから同一犯であることが分かった。カプセルと共に封印されていたブロンソン･スプリングスの過去とは? 足元に埋められていた25年前の恐怖が甦る。
海軍少尉が田舎道で遺体となって発見される。少尉が殺された原因はバーでケンカしたせいか、それとも友人の女性将校が受けた性的暴行について知りすぎたせいなのか。NCISチームは事件の真相を突き止めようとする。一方、ディノッゾとマクギーは体をすっきりさせようとクレンズを始めるが…。
ダラスのバーで、大学生が口論していた相手に殴り殺されるという事件が起き、その後、熟達した殺し屋が事件の証人やFBI捜査官を次々に殺していく。ジェーンは殺し屋の正体を突き止めようと奔走し、次に狙われるであろう、もう1人の目撃者の身を守るために作戦を練る。そして、リズボンの身の安全を確保するために、あることを指示する。
盗まれた核資材を隠し持っている疑いのある白人至上主義グループを調査する為、カレンとサムは、再び囚人と看守として身分を隠し、潜入捜査を開始する。
