中国系移民3人が全員生きたまま火葬されたという最近の事件を捜査していると、中国の幽霊に対する考え方が浮かび上がってくる。
全くの健康体だった海軍少佐が、放射性物質を含んだ毒を盛られ余命わずかと診断される。少佐はプライドとNCISにこの事件の解明を依頼する。
イランとの核不拡散条約締結を控える中、エリザベスはシラーズ大統領の暗殺計画に気づく。ジュリエットの潜伏先が判明し、対処を巡ってエリザベスとラッセルは言い争う。
国務省スタッフはアブハジアで迫害に遭っているLGBTQの市民を米国に亡命させるべく動いていたが、反発したラコバ大統領が国境を封鎖。ジェイとキャットは支援団体と手を組み、失敗すれば近隣同盟国との関係を壊しかねないリスキーな救出計画を実行する。将来について悩むジェイソンは叔父のウィルに相談を持ちかける。マットは雑学クラブにブレイクを誘い、ベイカー大尉と共にパブのクイズ大会に挑戦する。
有名な医師が殺害され、妻がレイプされる。ベンソン刑事とステイブラー刑事は、前妻との間に生まれた疎遠の不良息子と、恨みを抱く元患者に目を向ける。ところが、医師の元愛人が同じレイプ犯に襲われる。そこから複雑な人間関係と事件が展開し、妻も愛人も思いがけず厳しい尋問を受けることになる。
