ブレナンやジャック、ブースを襲った“墓堀人”ことタフェットの裁判が開廷。証拠が取り下げられるなど劣勢に追い込まれたブレナンたちは、タフェットの犯行を立証するため全力を挙げて手がかりを探す。
ベンの指示でマイクがアレハンドロの死体を闇へ葬り、一件落着かと思われた矢先に、チャックが未だに自分を疑っていると知ったブリー。仲間に相談したいが、深酒で仕事にならないカルロスの代わりに奔走するガブリエルも、結婚記念日を機にトムとやり直そうと目論むリネットも、相手にならない。そんな時、スーザンが胸の内をさらけだして描いた絵が、画廊のアートディーラー、フィリックスの目に留まり、自分の画廊に飾りたいと言い出す。頑なに断り続けるスーザンに業を煮やしたアンドレが取った驚くべき行動とは―。
NCISが隠蔽を行ったと訴えていたブロガーが死亡。チームは訴えの原因となった海軍大尉の死亡事故を再捜査することになる。
FBI長官フィックラーの証言に基づいて死刑が確定していた女性の再審理が申し立てられ、クーパーが証言を求められる。一方、クーパーはベスに脅威分析を任せる。
ジェーンは爆破事件に巻き込まれ、一時的に視力を失ってしまう。爆破の犯人と、ある殺人犯を追う彼は、視力以外の感覚だけに頼ることを余儀なくされる。だが、犯人が本当に狙っているのは意外な人物だった・・・。