年配女性を狙った連続殺人事件を捜査するためメキシコへ向かう。
ジェシーが娘のグレイシーとセーリングを楽しんでいると、突然襲ってきた海賊が乗客を人質にし、ジェシーに暴行する。チームは居場所を特定し、グレイシーを救えるのだろうか。
地下鉄職員レナード・レヴィットの銃殺体が、公園で発見された。背中は至近距離、胸は遠方から撃たれていることに検視官のラニは不審を抱き、キャッスルは遺体の胸ポケットから見つけた猛禽類の羽根に疑問を持つ。そしてレナードの自宅を捜索すると、暗視装置やパラボラマイクなど、何かを追跡するための装置があり疑問は益々深まっていく。やがてキャッスルの閃きの下、再び殺害現場を捜索するとレナードのカメラを発見。そこに残された映像が、事件を思わぬ方向に展開させていく。
対テロ会議で爆発事件が発生。NCISチームはギブスの宿敵の仕業ではないかと疑うが、ダイアンを殺された悲しみで危うい状態のフォーネルを支えるため、ギブスは捜査から距離を置く。
海軍予備役兵ベラミーが何者かに射殺される。ベラミーの携帯電話には予備役100人以上の名簿が入っており、カレンたちは彼が名簿を売ろうとしたと考えて捜査を進める。