私立検視官ボーモント・ローズウッド・ジュニアは、他人事とは思えない事件に携わる。調査を始めたローズウッドは、刑事アナリス・ヴィヤの協力を半ば強引にとりつけ探っていく。
シールドの基地に連行されたサージは、コールソンとそっくりなためエージェントたちの注目を集める。サージはマックに対し、「今日の終わりには俺が上に立つ」と謎めいた予言をする。そんな中、ディークがサージの追跡装置の暗号を解除し、シールドが2匹のシュライクを探知。宿主たちを確保するが、1つのモジュールに入れたところでメイとエレナが危険な状態に陥って……。
ある死刑囚が本当に有罪か否か、24時間以内に突き止めなければならない。エリック・デルコが真相解明のためにチームに戻ってきた。
いよいよ高校生活3年を迎えたジェナ。しかし休みの間マッティとべったりで、他の友人たちと連絡をしていなかった彼女は、ちょっと不安な気持ちで新学年を迎える。ヨーロッパ旅行へ行った親友タマラと元彼のジェイクはいつの間にかラブラブに、仲良しのミンやヴァレリー先生もどこかよそよそしい。不安は見事的中するが、実はもっと大きな不安をジェナは抱えていた...
イクスの爆弾により壊滅した“第13倉庫”。パンドラの箱に残されていた希望も吹き飛び、絶望が世界中の人々を襲う。金融市場は暴落し、街では自殺が多発していた。アーティーたちは1つの時計を手掛かりに、倉庫の安全装置となる遺物を捜し求める。彼らは世界一周を果たした航海家、マゼランの遺物にたどり着くが、一部の部品が欠けていた。その捜索中、クローディアは穴蔵に閉じ込められてしまう。