環境保護活動家が殺害され、テナントらNCISチームは、ある土地をめぐる環境団体とIT長者の争いに足を踏み入れることになる。テナントとミリアス大佐はデートをする。
パーカーは海軍少尉の不可解な死を捜査中、自分が成り済まし詐欺の被害者だと気づく。一方、関係を深めていたナイトとジミーは問題に直面する。
失踪の真相を調べるためLAへやってきたキャッスル。ホテルへ着くと伝説の団体「偉大なる探偵協会 (GDS)」から殺人事件の捜査を依頼される。2人の候補のうち、事件を解決したほうが会員になれるというのだ。ヘイリーとライアンたちの協力を得たキャッスルは有利に駒を進めるかに見えたが…。捜査の合間に失踪時のかすかな記憶を頼りに訪ねた韓国料理店では、1年半前のキャッスルについて意外な事実が分かる。
何かを探し求める謎の人物が、終末を迎えた世界で重要な資源をめぐる争いに巻き込まれる。
新たな居場所を求め、アリシアとニックは新しい集団に溶け込まなければならなかった。一方、マディソンはオットーの過去に自分との共通点があると感じる。