休暇中、カタリナ台風の犠牲者の身元確認を手伝うためニューオーリンズにいたブレナンは、暴行を受けた後、ニューオーリンズのモーテルの洗面所で血まみれのまま目を覚ました。しかし彼女は何も覚えていない。事件を聞きつけたブースは彼女の失われた一日の足取りをたどるが、地元の医師の遺体が発見されると、ブレナンが第一容疑者にあげられる。捜査を続けるブレナンとブースは、ヴードゥー魔術の世界へと導かれる。
問題だらけの混合家族が、各地で報告されているウィルスはウォーカーによる世界の終末の訪れであると気付き、必要に迫られて団結する。
軽い親切心からベンの新たなプロジェクトを手伝うことになったブリー。彼が企画する集合住宅の建設予定地へ案内されると、そこはアレハンドロを埋めたチャップマンの森だった。更にベンが一帯の環境調査を行うことを知ったブリーは、チャップマンの森の開発を阻止するため、ガブリエルとともにその調査に向けて先手を打つことに。その頃、スーザンはアンドレのアシスタントに抜擢されて大張り切り。ところが、任されたのはハロウィンの週末の間、彼の息子ジャスパーの面倒を見ることだった。
テロの脅威は続いていた。そして、ハッサン大統領の娘カイラの行動が思わぬ事態を招くことに… 一方、CTUのヘイスティングスは、テイラー大統領にジャックのチームがファラド救出に向かっていると報告。保護した後ファラドに犯人を特定させるため、ハッサンに工作員リストを提供してもらえるよう話してほしいと頼む。
生物兵器のガスを浴びたジャック。そしてホワイトハウスではオリヴィアが臨時首席補佐官に任命される。