マイケルとチームはベリックをまいて、ベリックはFBIに識見を委ねることを余儀なくされる。マホーン捜査官はマイケルの脱出計画の謎を解く。ティーバッグは、その手を取り戻すために大胆な決断をするが…。
刑務所の脱出に成功したマイケルたちは、それぞれの目的地へと向かう。その頃、FBI捜査官のマホーンは、リンカーンとマイケルを罠にはめるためLJを囮に使おうとしていた。裁判所での救出劇が、兄弟を追跡者のもとにもたらし…。
ベリックがマイケルとチームを捕獲するが、彼の目的は報酬ではなかった。ニカが罠にはめたのは一体誰なのか。アブルッチは家族との国外逃亡を予定していたが、彼の復讐心は自身を窮地に追い込むことになってしまい…。
喉をかき切られ、下着も着けていない無惨な女性の遺体が路地で発見された。ミーガンは想像を絶する事実を遺体から突きつけられる。彼女の脳はすべて掻き出されており、その残忍な手口には見覚えがあった。かつてミーガンの検死により有罪が確定、終身刑で服役中の連続殺人鬼・ウィルソン・ポーリーのそれとまったく同じものだったのだ。ミーガンは意を決して刑務所のウィルソンを訪れる。
元国家安全保障局のコンピュータースペシャリストが、早朝にセルビアのギャングに襲撃され誘拐された。スティーヴたち特別捜査チームは彼を救出するべく捜査を開始する。一方チンは多忙の中、コノの警察学校の卒業パーティに出席しようと努力する。