ステイブラーは仕事で忠誠心を試され、さらに母親の思いがけない登場により家族への忠誠心も試される。ベルとジェットは新たに設立された合同対策班のかじ取りをする。
父親の真実と向き合うステイブラーは、知らず知らずのうちに自分と「組合」との関係に影響を与える。特捜班は姿を消したウェブを捜索する。ドネリーは捕まらないようにするために手段を選ばない。
新任の検事補が、必要な証拠を入手するため、「組合」のうちの1人を寝返らせるよう特捜班を促す。ステイブラーは父が残したものと向き合わねばならない。ベルとノバの世界が様々な形で重なり始める。
ステイブラーはフルートラが組織で担う本当の役割を知る。ベルはキルブライドに捜査への協力を頼む。同居し始めたバーナデットとイーライは折り合いを付けていく。
イーライが行方不明になり、ステイブラーはベンソンと特捜班に捜索の協力を求める。ウィートリーは自分の未来を考える。