太陽系の惑星直列によって地球各地で天変地異が起こっていた。故郷から船で脱出した剣だが、嵐によって遭難。海に放り出されたところを巨大な白鯨に助けられ、イースター島に連れて来られる。そこには同じ夢を持ってやってきた、譲、麗、信、学の姿もあった。

剣たちはマドーラに連れられ、聖者ラ・ムーと対面していた。そこでラ・ムーは、アトランティスが地球に眠るオリハルコンを手に入れ、大陸ごと地球に移住してくるつもりであることを告げる。

ラ・ムーと初対面し、地球をアトランティスの手から救えと告げられる5人だが、剣だけは反発。イースター島の海底神殿を飛び出し、両親の仲間のいる場所に戻ろうとした。だが、故郷は、アトランティス軍の地底探知機のせいで富士山が噴火、跡形もなく破壊されていた。

ムーの戦士として戦うことを決意した剣たちは、ミューに誘われ、白鯨の中に入った。ラ・ムーの導きによってそこで見たものは、3万年前の世界。そこで自分たちそっくりのムーの若者を見るとともに、マドーラがラ・ムーの娘だったことを知る。

アトランティス軍は白鯨が出現したことで、宿敵ラ・ムーの存在を確信する。一方、ラ・ムーは、剣たち5人に白鯨を操縦することを委ねる。そんな時、地球派遣軍副指令官プラトスは、アトランティス精鋭部隊を率い、白鯨を倒すべく来襲してくる。

月基地への先制攻撃を思いつく剣たちだが、白鯨は動かない。そんな時、麗とマドラーは、予知能力で剣が死んでしまうと予感する。そして白鯨の能力を分析したアトランティス軍は、巨大なコンドル要塞を出撃させた。アトランティス軍の来襲にムーバルで出撃する剣たちだったが…!?