若い女の全裸殺人事件が発生。その事件の容疑者は、宗方が勤務する渋谷病院に入院していた。黒岩は容疑者の退院を待って逮捕するつもりでいた。そんな時、商店が襲撃される事件も起こってしまう。

城西女学院を退学になった非行少女・モモ子とその友人が男を連れて母校にお礼参りに現れた。3人は校内の放送室を占拠。さらに、黒岩の説得を聞かずにライフルを乱射して、3億円を要求してきた。

汚職事件の真相を追っていた業界紙記者の市村が狙撃されてしまう。彼は死の直前、犯人として大物財界人の名を挙げた。捜査を始めると、黒岩らの前に身代わり犯人が出現。そして上層部からは捜査中止命令が下る。

射撃場帰りのエリートが、暴走族に絡まれて思わず射殺してしまった。現場に駆けつけた黒岩は、暴走族側に1人脱走した者がいることを確認する。黒岩は、その者を保護しようと動き出すのだが…。

若い娘が宮本刑事の拳銃を狙ってきた。逮捕された娘は黙秘権を使って何も喋らない。黒岩は彼女が暴走族の直美と張り合っていたことを突き止める。直美は拳銃の弾丸を持っていて、それは犯罪に使用されたものだった。

東京都知事宛に過激派グループから脅迫状が届いた。彼らは犯罪者の釈放と5億円の引き渡しを要求し、応じない場合は東京を壊滅させるという。また、黒岩たちは犯人たちが大量のダイナマイトを入手したことを知る。