時代が変わり雑然とした明治新京都の町に一人の青年が降り立った。名を坂本竜之介。かの維新の英雄・坂本龍馬の息子である。母、おりょうの手紙を受け取った竜之介は日本に帰国し、京都の町に戻ってきた。一方、京都の町に跋扈する無許可妖怪を取り締まるべく奮闘している集団があった…。

相変わらず赤字続きで経営に苦しむ新撰組は、今日も借金取りの浦沢センに厳しく取り立てられ、源内の新発明を担保として取り上げられる始末。この現状をなんとかしなければと考えた竜之介は新規の株を発行することを企画するが…。

西洋喫茶「シャムル」は竜之介と猫丸がよく行くお店。竜之介は「シャムル」の看板娘・山崎小夜子とも仲が良い。竜之介が上海に戻るのではという噂が流れた時、勇子はそれを阻止するため、竜之介と小夜子が結ばれるよう画策し、源内が“ほれ薬”を作り出すのだが…。

イマイチ女性に興味を示さない竜之介を心配する新撰組の面々。なんとかならないかと考えたあげく竜之介を祇園の町に連れ出し、“舞妓遊び”を経験させようとしたが、そこで竜之介は小雪という舞妓さんと出会い…。

竜之介と小夜子をくっつけようと、またもや画策する勇子。そんな折、源内が心理学を応用した作戦を思いつき、早速実行に移してみようと考えた勇子は竜之介と小夜子を万博博覧会会場に呼び出して…。