医学部を卒業したばかりの新米研修医、JD。彼は一風変わった患者を抱え、セイクレッド・ハート病院の医者からのひどい仕打ちにも耐えなければならず、自分の無能さを痛感する。研修医のタークとエリオットも加わる。病院の先輩コックス医師や、彼を殺そうとしているかもしれない社会不適合者の用務員の相手もしなければならない。
皮肉っぽいコックス医師が、受け入れてもらいたいと切実に思っているJDに迫る。気が利かないエリオットは、タークに言い寄られているカーラを怒らせる。
JDとタークの間では、仕事とプライベート両方の場面で友情が試される。一方エリオットとケルソーの間には性差別の問題が出てくる。
JDは瀕死の女性との絆を深める。タークはヘルニア患者の手術を行い、エリオットは乱暴なカーラの相手をする。
JDは、技術的なミスと思われる点をケルソー医師に指摘する。しかしそれは、死んだ男の保険を使い、保険に入っていない女性を救おうとしているコックス医師の仕業であった。
コックス医師は現在も停職の危機に直面している。偶然にもJDは特別な患者、すなわち重要な役員であるジョーダンを担当することになる。要求が多いジョーダンだが、JDは最終的に彼女と寝てしまう。だが彼女はコックス医師の元妻だった。邪悪なケルソー医師に解雇されかけているJDの師匠を救えるのは彼女しかいない。
ザック・ブラフ
Dr. John "J.D." Dorian
ドナルド・フェイソン
Dr. Chris Turk
サラ・チョーク
Dr. Elliott Reid
ジュディ・レイエス
Nurse Carla Espinosa
ジョン・C・マッギンレー
Dr. Perry Cox