비비안과 바이올렛은 자신들이 과거의 사건과 소름 끼칠 정도로 유사한, 위험한 상황에 부닥쳤다는 것을 알게 된다. 벤은 잘못을 바로잡기 위해 보스턴으로 돌아간다.
그 누구도 예상하지 못한 의외의 인물에게 도움을 요청하는 콜슨과 헌터. 둘은 그랜트 와드와 위험한 동맹을 맺는다. 쉴드 파벌 간의 전쟁이 계속되면서 스카이와 링컨은 이 갈등에 말려들게 된다.
로버트 곤잘레스가 행동을 개시하고 콜슨은 쉴드의 미래를 지키기 위해 무슨 일이든 해야 한다. 한편, 스카이는 자신의 힘을 통제하는 과정에서 링컨이라는 이름의 불가사의한 인휴먼을 만나며 놀라운 전환을 맞이한다.
콜슨이 자신의 부활과 관련된 외계 도시를 알게 된 후, 콜슨과 팀은 비밀이 히드라 세력의 손에 넘어가기 전에 도시를 파괴한다. 하지만 새로운 위협이 나타나는데. 전 쉴드 요원 와드와 에이전트33과의 동맹, 스카이의 아버지, 비인간적인 존재로 변화하기 위해 고군분투하는 레이나, 그리고 오벨리스크로부터 신비한 새로운 능력을 얻게 됐지만 그 능력에 대한 경험 부족으로 사랑하는 이들의 안전을 위협할지도 모를 스카이도 포함이다.
콜슨과 곤잘레스 간의 전쟁에서 기로에 서게 된 멜린다 메이. 그녀가 '기병대'로 변하게 된 사연이 드러난다. 스카이는 링컨으로부터 자신의 진정한 뿌리에 대해 더 듣게 되고, 진실은 그녀를 새로운 방향으로 이끈다.