미니특공대의 기원이 소개되고 작품의 주인공인 대원들의 멋진 활약이 펼쳐진다. 동물들을 싫어하는 악당, 나인이 기계몬을 보내 동물들을 괴롭히자 대원들이 힘을 합해 막아낸다.
미니특공대의 배신자 파스칼과 나인이 손을 잡는다. 파스칼이 투를 거대화시켜 변전소를 파괴하려 하지만 미니특공대는 특공로봇으로 공격해 막아낸다.
거미 기계몬이 나타나 동물의 에너지를 뺏으며 괴롭힌다. 출동한 미니특공대도 거미줄에 당할 위기에 처하지만 기지를 발휘해 거미기계몬을 물리치고 동물들을 구해낸다.
볼트가 동그라미를 조심하라는 운세를 받고 불안해한다. 마침 전갈 피오와 싸우다가 동그란 마비광선을 맞은 볼트는 패닉상태에 빠진다. 하지만 대원들의 응원에 힘을 낸 볼트, 두려움을 이겨내고 피오를 물리치는데 성공한다.
폭군 거북이 토레스가 파스칼의 음모에 따라 거북이들을 괴롭힌다. 미니특공대가 출동해 싸우지만 토레스의 강한 등껍질 때문에 애를 먹는다. 겁을 먹고 물러서기만 하던 거북이들이 용기를 내서 힘을 합하고, 미니특공대가 승리한다.
파스칼이 이구아나 여왕의 알을 훔쳐다가 미니특공대에게 떠넘긴다. 아기 베베가 태어나고 대원들은 마음을 다해 보살핀다. 여왕의 오해와 파스칼의 음모로 모두가 위험에 처한다. 하지만 감춰진 베베의 능력이 발휘되면서 파스칼을 물리친다.
엄상현
Volt
전태열
Sammy
신용우
Max
이소영
Lucy
사이먼 소켓
Nein