소닉X

어느 날 소닉은 에그맨과 싸우던 도중 수수께끼의 기계를 작동시키고 만다. 그리고 거기서 발생한 거대한 에너지로 인해 시간과 공간이 어긋나고 소닉과 친구들은 에그맨 군단과 함께 시공간의 뒤틀림에 빨려 들어간다. 잠시 후, 정신을 차리고 보니, 그곳은 마치 지구처럼 ‘인간’들이 사는 곳이었다. 알 수 없는 곳에 떨어져 어리둥절해하는 소닉을 잡기 위해 경찰들이 출동하고, 소닉은 경찰들과 달리기 경주를 벌이게 된다. 경찰들을 따돌린 소닉은 수영장에 빠지고, 그곳에서 크리스를 만나게 되는데...

수영장에서 소닉을 건져낸 크리스. 둘은 친구가 된다. 그리고 뉴스를 보다 달려온 크리스의 할아버지 척도 소닉의 존재를 알게 된다. 그런데 뉴스를 보던 중에 소닉의 친구인 크림과 치즈가 사람들에게 붙잡혔단 사실을 알게 되고, 소닉은 크리스와 할아버지의 도움을 받아 크림과 치즈를 구하시 위해 군사 시설인 99지구로 달려가는데...

평화로운 도시에 닥터 에그맨이 나타나 에그맨 제국을 세울 거라며 도시를 자신에게 넘기라고 한다. 하지만 소닉은 산책을 나가고 없어 테일즈와 크리스가 출동하지만 에그맨을 막기엔 역부족이었다. 고전하는 테일즈를 보고 도시의 지하를 헤매던 에이미와 너클즈까지 가세하지만 에이미가 에그맨의 로봇에게 잡혀버리는 사태까지 발생하는데...

7개를 전부 모으면 세상의 모든 걸 손에 넣을 수 있다는 카오스 에메랄드. 카오스 에메랄드가 일으킨 카오스 컨트롤 때문에 이 세계로 날아온 소닉과 친구들은 7개의 카오스 에메랄드를 모두 모으면 원래 있던 세계로 돌아갈 수 있을 거라 생각한다, 그러던 중 건설 현장에서 카오스 에메랄드가 발견돼 소동이 벌어지고 소닉과 친구들 그리고 닥터 에그맨까지 카오스 에메랄드를 차지하지 위해 출동한다. 결국 카오스 에메랄드를 둘러싸고 소닉과 에그맨의 싸움이 벌어지게 되는데...

에그맨은 너클즈를 찾아가 카오스 에메랄드 7개를 모두 모으면 다시 카오스 컨트롤을 일으켜 원래 세계로 돌아갈 수 있다며, 자신은 고향으로 돌아가 남은 인생을 보내고 싶단 얘길 한다. 그런데 소닉이 원래 세계로 돌아갈 생각도 없으면서 카오스 에메랄드를 빼앗아갔다며 자신을 도와달라고 사정한다. 에그맨한테 감쪽같이 속아넘어간 너클즈는 소닉에게 결투를 신청한다. 한편 실버 벨리에서 기계 이상이 일어났다는 뉴스를 보고 크리스와 테일즈 그리고 에이미는 카오스 에메랄드를 찾아 그곳으로 달려갔다가 에그맨에게 잡히고 마는데...

크리스네 반에 E51이라는 로봇 선생님이 찾아온다. E51은 에그맨인 아이들이 자신을 존경하도록 교육하기 위해 파견한 로봇이었다. 하지만 아이들과 지내는 사이에 아이들이 E51을 존경하게 되자, E51은 에그맨의 명령을 잊고 자신이 존경받는 걸 기뻐하게 된다. 이를 보고 화가 난 에그맨은 크리스네 학교까지 달려와 아이들이 자신을 존경하게 될 때까지 보충수업을 하지 않으면 분해하겠다며 E51를 협박한다. 크리스는 아빠, 엄마가 집에 오시기로 한 날이라 집에 빨리 가려하지만 에그맨과 E51 때문에 학교에 잡혀있게 되는데...