사람의 도리를 벗어난 귀신의 알 99개와 마녀의 영혼 1개로 사신의 무기인 데스사이즈가 된다. 사신 무기 장인 전문학교, 줄여선 사무전. 그곳 학생인 낫 장인 마카와 마의 낫인 소울 이터의 이야기가 시작된다. 귀신의 알 99개를 모은 마카와 소울은 마녀의 영혼 1개로 데스사이즈를 완성할 예정이었다. 하지만 찾아간 마녀 블레어는 마녀가 아닌 마력이 센 고양이였다. 결국 지금까지 모은 99개의 영혼이 몰수되고 다시 처음부터 시작하게 된다.
암살자인 블랙 스타는 암살자답지 않게 눈에 띄는 걸 좋아한다. 그런 그의 파트너인 사슬낫 츠바키. 둘은 실력이 좋지만 블랙 스타의 눈에 띄는 행동 때문에 아직도 영혼을 하나도 못 모으고 있다. 그런 그들에게 사신은 마녀를 지키는 호위 무사 미후네와 싸울 것을 제안한다. 마침 귀신의 알이 된 알 카포네 일행도 마녀 안젤라를 노리고 간 상황. 잘하면 99개의 영혼과 마녀의 영혼 1개를 한번에 모을 수 있는 기회를 잡기 위해 블랙 스타는 미후네와 싸우는데...
좌우대칭, 완벽함을 추구하는 사신님의 아들 키드. 그는 좌우대칭을 위해 쌍권총을 사용할 만큼 지나치게 완벽함을 추구한다. 그런 그에게 사신은 아비누스의 파라오를 부활하게 하려는 강령술사 마녀와 미라를 잡으라는 지시를 내린다. 아비누스의 완벽한 좌우대칭을 감상하는 것도 잠시, 키드는 집 현관에 있는 액자가 기울었을 거라는 생각에 휩싸인다. 결국 미션 수행 중에 키드는 집으로 가고 리즈와 파티가 미라를 상대하는데...
아직까지 영혼을 하나도 못 모은 마카, 소울, 블랙 스타, 츠바키는 퇴학 위기에 처한다. 그런 그들에게 자유 여신이 이마에 박혀서 사망했으나 누군가에 의해 좀비로 변한 시드 선생을 처리하라는 지시가 떨어진다. 네 사람은 시드 선생의 무덤이 있는 공동묘지에서 좀비로 변한 시드 선생과 싸운다. 생전에 삼성 장인이었던 시드는 무척이나 강해서 좀처럼 이기기가 어려운데...
슈타인 박사 연구소에 도착한 마카 일행은 슈타인 박사와 대결을 하게 된다. 싸우는 중에도 슈타인 박사는 각자의 특징을 잡아낸다. 특히 마카에게는 자신의 연구 대상이었던 데스사이즈와 결혼한 마카의 엄마에게 원한이라도 있다는 듯이 마카를 연구 대상으로 삼겠다며 괴롭힌다. 압도적인 실력 차이로 좌절하는 마카 일행. 다시 힘을 내고 영혼의 공명으로 마녀사냥이라는 스킬을 쓰지만 불완전해서 실패하고 만다. 절체절명의 순간, 과연 마카 일행은 슈타인 박사를 이길 수 있을까?
새로운 담임으로 부임한 슈타인 박사. 그리고 신입생으로 들어온 키드. 신입생으로 사신의 아들인 키드가 온다는 말에 블랙 스타와 소울은 키드를 상대하기 위해 수업도 빼먹고 키드를 기다린다. 드디어 키드가 도착하자 블랙 스타와 소울은 키드 일행과 대결한다. 하지만 영혼의 파장이 맞지 않는 블랙 스타와 소울은 키드의 상대가 되지 않는데... 과연 대결의 결과는 어떻게 될 것인가?
로라 베일리
Maka Albarn
체라미 리
Patricia "Patty" Thompson
브리트니 카바우스키
Black Star
마이카 솔러소드
Soul Eater
제이미 마키
Elizabeth "Liz" Thompson