Den to år gamle sønnen av det unge paret fra "den blå lagune" reddes av et skip. Ombord herjer imidlertid kolera og gutten, sammen med en liten pike og hennes mor settes ut i en liten båt. Etter å ha drevet rundt i flere dager havner den på en ukjent øy. De to barna vokser opp, moren dør, og de to unge må begynne å finne ut av livets dypere hemmeligheter.