Mark Galasso

Pomimo śmierci partnera Sydney próbuje wydostać się ze szpitala dla umysłowo chorych, żeby ratować własne życie. Opracowując plan ucieczki, odkrywa, jaką rolę w przeszłości odegrał w jej życiu Shepard. Sloane przedstawia dowody w sprawie wtyki CIA – Przymierze dochodzi do wniosku, że w szeregach SD-6 znalazł się kret.

Sydney opowiada Jackowi o śnie dotyczącym Willa. Tożsamość tajemniczego „St. Aidana” zmusza Sydney do wyciągnięcia oszołomionego Willa z programu ochrony świadków. Jednak dwójka starych przyjaciół spotyka na swojej drodze Allison – kobietę, która zrujnowała życie im obojgu. Tymczasem fanatyczny Lindsey aresztuje Jacka i Vaughna za udział w konspiracji dotyczącej uwolnienia Sydney z aresztu NSC. Sloane, pod presją Lindseya, wprowadza w życie plan pozbycia się Sydney.

Sydney i Jack stają twarzą w twarz z nowym dyrektorem SD-6 (Rutger Hauer), który zastępuje zaginionego Sloane'a, którego miejsce pobytu oraz zamiary są nieznane. W międzyczasie Francie i Will zaczynają się mieć ku sobie.