Farbror kung Julien abdikerar och överlämnar kronan till prins Julien. Kung Julien den trettondes styre kan börja!

När Kung Julien får veta att 99 av lemurerna älskar honom ger han sig ut för att hitta och omvända den enda som inte gör det.

Det elaka geniet Karl försöker förstöra för kung Julien. När både Clover och Maurice blir tillfångatagna måste kung Julien rädda dem från sin nya fiende.

Kung Julien är trött på att lösa sina undersåtars tvister hela dagarna, så han ersätter sig själv med en docka så att han kan skolka - vilket utlöser ett uppror.

Juliens farbror vill återta tronen, så han övertalar sin brorson att bege sig till Foosa-land. Julien tillverkar en förklädnad och tvingar Maurice att följa med honom.

Katja tvingas ta semester och medan hon är borta träffar hon den stilige och frigjorde Salvi Måndansar.