Al investigar un caso de robo durante un vuelo, Riggs y Murtaugh persiguen a un padre poco confiable cuya hija es su testigo principal. Mientras tanto, Murtaugh enfrenta la hostilidad de su propia hija.

Riggs se reúne con sus amigos de la infancia y se da cuenta de que podrían estar involucrados en un caso de robo y homicidio que él está investigando con Murtaugh.

Se suspenden las vacaciones familiares de Navidad de la familia Murtaugh cuando él y Riggs investigan la muerte de un viejo amigo. Riggs recibe una sorpresiva llamada de un pariente.

Mientras Riggs y Murtaugh investigan la muerte de un surfista, Murtaugh comienza a sospechar del nuevo amigo de Trish, SCOTTIE PIPPEN. Riggs tiene violentas pesadillas sobre su infancia.

Un grupo de adolescentes se involucra en un caso de dinero falso, lo que afecta profundamente a Murtaugh. Mientras tanto, Riggs visita a alguien de su pasado.

Murtaugh y Riggs investigan el asesinato de un paciente fugitivo de la Dra. Cahill, quien pierde el rumbo misteriosamente. La situación revela un complot más grande del que imaginaban.

Cuando Jess (ALISHA WAINWRIGHT), la hermana de la detective Bailey, se mete en problemas con la ley, esta última debe decidir hasta dónde está dispuesta a llegar para proteger a su familia.

Riggs intenta conectarse con su padre, Murtaugh le enseña a conducir a su hija, y el equipo enfrenta un incidente peligroso que pone a prueba su confianza.

En el primer día de Murtaugh como capitán interino, secuestran a la esposa de un popular empresario y el escuadrón encuentra una conexión con el caso del padre de Riggs (REX LINN).

Murtaugh y Trish cuestionan su confianza en Riana cuando ella se mete en problemas. Riggs encuentra en Molly y Ben una familia de verdad.

El equipo investiga el incendio ocurrido en una sala de fiestas en la que han muerto 16 personas. Las pistas indican que el fuego fue provocado para ocultar un asesinato.

Una explosión en un viejo caserón casi mata a Horatio y al equipo justo después de haber encontrado un cadáver. El caso adopta un carácter personal para Horatio cuando descubre que el principal sospechoso conoció a su hermano asesinado. El titulo en inglés "Freaks and Tweaks" es similar es similar a la sitcom de la NBC Freaks and Geeks que tuvo una corta duración.

La investigación de un tiroteo cuando se transportaba droga a una incineradora supondrá una gran tensión para los trabajadores del CSI, al sentirse sospechosos del crimen que están intentando solucionar. Asuntos Internos cree que alguien del equipo dio el chivatazo del transporte de la droga.

El equipo investiga dos muertes de estudiantes que se encontraban en Miami durante las vacaciones de primavera. La primera es una adolescente encontrada muerta en la playa con el cuello roto y con marcas de mordiscos en sus piernas. El segundo cuerpo es el de un joven encontrado en el fondo de la piscina de un motel y que aparentemente murió antes de caer al agua.

Jill lleva a Tim, Wilson, Al y Heidi a hacer rafting fluvial para el cumpleaños de Tim, pero él solo quiere descansar ese día. Brad y Mark intentan eliminar una mancha de refresco de uva del sillón.

En este final de temporada, el equipo está en alerta tras una aparente amenaza contra la vida de Riggs. Molly le pide a Riggs que tome una decisión importante sobre su futuro.

Horatio se confiesa con un antiguo amigo que ejerce como cardenal y que es una de las pocas personas al corriente del secreto del policía. Cane se muestra afligido y atormentado por los hechos que ambos conocen. La charla es interrumpida por el ruido atronador de unos disparos en un cementerio cercano.Durante el funeral de la madre de un presidiario, un asesino ha salido del ataúd supuestamente ocupado por el cadáver y ha acribillado a tiros al preso y a su escolta.

La escena del crimen se traslada a un juzgado en el que algunos miembros de la peligrosa banda “Mala Noche” han irrumpido a disparos en el momento en el que se estaba condenando a su líder. Ese mismo lugar ha sido el elegido por Horatio y Marisol, hermana de Delko, para casarse: Caine está en el punto de mira de un francotirador.

El pánico se apodera de una familia, que se encuentra a bordo de un yate envuelto en llamas y rodeada de un mar lleno de tiburones. Lo que se encuentran los CSI es un escenario de ceniza y sangre. A pesar de que el mar está infestado de tiburones, la adolescente de la familia, Julie, se lanza al agua. Su hermano Luke no duda en intentar rescatarla, pero lo único que queda de ambos es una gran mancha de sangre sobre las olas.

En este último capítulo de CSI Miami, Horatio dispara al asesino de su mujer. Antonio Riaz, que fue el que atacó a Marisol el día de su boda con Horatio, continúa en paradero desconocido. “H” y el agente Delko, hermano de la fallecida, siguen su pista.