Bones viene coinvolta in un'indagine dell'F.B.I. per scoprire l'assassino di una ragazza massacrata quasi due anni prima. Grazie alla sua abilità nell'interpretare indizi sui resti umani, la dottoressa Brennan indirizza le indagini verso la giusta soluzione.
Diane si insospettisce quando diventa nuovo partner della Reddick, Boseman & Kolstad. Maia affronta le ripercussioni del piano Ponzi della sua famiglia. Lucca e Maia raccolgono inaspettatamente un nuovo caso.
Una serie di flashback svelano i tumultuosi eventi che hanno portato alla tossicodipendenza di Sherlock nella seconda parte del finale di stagione.
Carrie e Franny vivono a Brooklyn, dove Carrie lavora come avvocato per gli Americani Musulmani. Dar e Saul ragguagliano il Presidente Keane. Quinn deve affrontare delle situazioni nuove.
Carrie e Reda lottano per il loro cliente, mentre Quinn con la sua nuova vita. Saul e Dar sospettano che Keane abbia un segreto.
