Een verkrachting op een campus onhult een schoolbestuur dat het onderzoek in de weg ligt, wat leidt tot meer tragedie.
Alex moet tijdens een hoorzitting van het Congres getuigen over de terroristische bomaanslagen. Ze is ervan overtuigd dat Elias niet alleen handelde en is vastbesloten om antwoorden te vinden en de waarheid te achterhalen. Terug in de tijd in Quantico, voegt een nieuwe groep rekruten zich bij Alex en haar klasgenoten, wat leidt tot spanningen en wedijver tussen de verschillende groepen rekruten.
Een terreurcel probeert te infiltreren in Quantico, waardoor Miranda en Liam een dodelijke prijs moeten betalen. In de toekomst krijgt Alex nog steeds instructies van de terrorist en hangt het leven van Claire Haas aan een zijden draadje.
In Quantico werken de nieuwelingen samen in het kader van een training in defensief rijden, terwijl de spanning tussen Liam en Drew tot een uitbarsting komt, wat leidt tot schokkende bekentenissen en gevolgen. In de toekomst worstelt Simon met zijn nieuwe realiteit na wat er allemaal heeft plaatsgevonden.
In Quantico krijgen de nieuwelingen een oefening die iets te dichtbij komt voor Shelby. In de toekomst vindt Alex een onwaarschijnlijke bondgenoot in Hannah terwijl ze probeert de terrorist ervan te weerhouden om opnieuw toe te slaan.