Mentre indagano su un corpo che potrebbe essere di un capo-mafia, Booth e Brennan lavorano anche su dei crimini seriali.
Dexter si chiede se sia giusto seguire il codice del padre e spera di trovare risposte seguendo il "Trinity Killer" in un viaggio. Intanto, Debra scopre che la sua ricerca del "Trinity Killer" le ha impedito di accorgersi della verità.
Proprio quando Dexter riesce a trovare un equilibrio tra famiglia, carriera e identità segreta, tutto viene mandato a monte dalla sua nuova vittima. Debra, intanto, mostra un certo interesse nei confronti del passato del padre, sgradito a Dexter.
Murder è catapultato nel 1939 su una misteriosa nave dove cerca di impedire ai nazisti di uccidere.
Dopo un tentato suicidio, un paziente richiede un intervento di chirurgia ricostruttiva facciale. Christian tenta una mossa rischiosa con Kimber per intensificare la passione coniugale.