物語はロサンゼルス、大統領予備選の当日、深夜0時からスタートする。 ジャック･バウアーはCTUにおいて、大統領候補デイビッド･パーマーを暗殺する計画があることを知らされる。一方、ジャックの娘キムは家を抜け出し、妻テリーは彼女を探しに行く。
モハーヴェ砂漠上で旅客機が爆発した後、ジャックはその調査と同時に、パーマー上院議員の暗殺容疑者そして娘の居所を探し続ける。そんな中、極秘情報を入手したリチャードは何者かに銃撃され、ジャックに助けを求める。一方パーマーは、そのキャンペーンを阻む新たな脅威の存在を知る。
キムとジャネットは窮地に追い込まれ、脱出のルートを探す。キムを探すため、テリーはジャネットの父アラン･ヨークに助けを求める。パーマーは機密会議に出席し、ジャックはテロリスト組織へと繋がる可能性のあるキーカードを手に入れる。
CTUは、パーマー暗殺計画にバックアッププランがあることを突き止める。それは、更なる外国人スナイパーが、既に国内に存在している可能性だった。一方、パーマーは、彼のキャンペーンの後援者が彼を脅迫していることに対処しなくてはならなかった。
テリーとキムは、CTU職員の護衛のもと安全な場所へと移送される。一方、CTUの官僚的な妨害を押し切って、パーマーは尋問中のジャックとの対面を要求する。パーマーの力により、ジャックはCTUに復帰、捜査に戻るのか…。
