Im Dorfe Konoha, inmitten des Reichs des Feuers, lebt der junge Boruto Uzumaki. Er ist der Sohn von Naruto Uzumaki, dem großen Helden und amtierenden Hokage. Boruto leidet darunter, dass sein Vater nur selten Zeit für ihn findet, aber nun beginnt ja seine Geschichte …

Nachdem er für seinen letzten Streich direkt die ersten beiden Wochen an der Akademie suspendiert wurde, nimmt Boruto nun endlich am Unterricht teil. Aber nicht jeder seiner Klassenkameraden hat Verständnis dafür, dass er sich scheinbar mehr erlauben darf als andere …

Die Kinder haben Training mit den Shuriken. Doch Metal Lee scheint sich sehr ungeschickt anzustellen, wenn er nervös wird. Was die Jungs ziemlich in die Bredouille bringt. Und als man Metal sagt, er möge sich besser unter Kontrolle halten, geht der erst richtig ab …

Klassenlehrer Shino Aburame fordert, dass sich die Teams in geschlechtsspezifische aufteilen. Ihr Ziel ist es, die Flagge auf dem Dach zu erobern, weshalb die Jungen direkt durchstarten. Doch sind zu stürmisch und geraten in die Falle der Mädchen.

Der Schulwechsler und nicht ganz koschere Bleichgesicht, Mitsuki, wird in Borutos Klasse versetzt. Jedoch wirkt er etwas seltsam. Shino-sensei beschließt sich daraufhin eine Willkommensfeier abzuhalten, um ihn in die Klasse besser zu integrieren.

Shino verhält sich anders als sonst und attackiert Boruto und seine Freunde mit Insekten. Shino-sensei wird ebenfalls von dem Wahn überwältigt und ruft Boruto, Shikadai und Mitsuki zu sich. Ihre Lektion soll tödlich enden, weshalb sie fliehen.