Nachdem sie das erste Oberstufenjahr in Ruhe und Frieden verbracht hatten, trafen Haruka und Makoto Nagisa, einen neuen Studenten, der ein Mitglied eines Schwimmclubs war, als sie Kinder waren. Der Schwimmclub wird abgerissen, also schleißen die drei sich dorthin, um eine Zeitkapsel auszugraben, als sie sich plötzlich mit dem vierten Mitglied der Gruppe, Rin, vereinigt finden, der damals gega...

Makoto und Nagisa beobachten gespannt mit angehaltenem Atem wie Haruka und Rin gegeneinander um die wette schwimmen. Sie bemerken allerdings, dass sich Rin verändert haben muss. Gleichzeitig beginnt Nagisa, mit der Hilfe von Rin's Schwester Gou damit, einen neuen Schwimmclub zu eröffnen.

Der Iwatobi-Schwimmclub braucht mehr Mitglieder bevor an Staffettenwettkämpfen teilgenommen werden kann. Nagisa setzt seine Hoffnungen auf seinen Mitschüler Rei, der Mitglied im Laufclub ist. Obwohl Rei abgelehnt hat, plant Nagisa weiterhin ein ihn zu rekrutieren.

Der Iwatobi-Schwimmclub ist jetzt vollbesetzt!Schon zu Beginn der Übungen gibt es allerdings Ärger.Nachdem ein gewisses Mitglied meint, die Schwimmkleidung sei schuld, unternimmt der Club einen Ausflug, um sich neue Ausrüstung zu besorgen.

Haruka und die anderen Mitglieder entscheiden sich dazu ein Trainingscamp zu veranstalten, um sich für die Präfekturausscheidungen vorzubereiten. Jeder trainiert nach eigener Einschätzung. Allerdings ist Rei unglücklich, weil er zurückfällt, also schleicht er sich nachts zurück zum Meer um zu trainieren.

Am Strand gibt es Probleme. Die vier Schwimmclub-Mitglieder sind dazu gezwungen, ihre Motivation zum Schwimmen zu überdenken. Als Rei Makoto auf sein merkwürdiges Verhalten während des Trainingscamps anspricht, erzählt Makoto ihm von seiner Vergangenheit.