Emelia Burns

Wanneer Elisabeth, Jim, Malcolm en Taylor radiostilte onderzoeken in een nabijgelegen wetenschappelijke buitenpost, ontdekken ze een uitbraak van een mysterieus virus dat geheugenverlies, paranoia en mogelijk de dood veroorzaakt. De groep moet samenwerken om een genezing te vinden voordat ze hun verstand verliezen en heel Terra Nova besmet raakt.

Lucas racet om de laatste stukken van zijn mysterieuze apparaat in elkaar te zetten, voor de aankomst van de elfde pelgrimage. Jim en Taylor confronteren de 'Sixer'-mol van de kolonie. Skye wordt herenigd met een bekend gezicht en Terra Nova bereidt zich voor op oorlog.

Lucas martelt Jim, zodat hij Taylors locatie vertelt. Elisabeth gebruikt als dokter van de kolonie haar medische kennis om Lucas' eenheid over te halen om Jim te bevrijden. De Shannons worden voortvluchtigen en Washington maakt een offer om ze te helpen de kolonie te ontsnappen en naar Taylor te gaan in de jungle. Mira wacht tot de Terminus is hersteld, zodat ze terug kan keren naar 2149. Ondertussen vindt Weaver iets in de woestenij: een gebied met een verrassend geheim. Het ziet er niet goed uit en Taylor bedenkt een wanhopig plan om de invasie te stoppen, maar waardoor het leven in Terra Nova voor altijd zal veranderen.

De elfde pelgrimage arriveert in Terra Nova, waaronder Josh' vriendin. Vlak achter haar is een pelgrim met een bom van Lucas' mensen. Jim wordt getroffen door de ontploffing. Hij wordt drie dagen later wakker en ziet dat Terra Nova getransformeerd is. Lucas en Mira hebben de leiding, de beveiliging wordt geleverd door de huurlingen van de Feniksgroep en Taylor is vermist. Jim doet alsof hij hersenletsel heeft en half doof is, en begint te werken in Boylans bar om de Fenikssoldaten af te luisteren. Ondertussen vindt Elisabeth een belangrijke aanwijzing naar Taylors locatie. Lucas plant een enorme bom in de jungle om al het gebladerte en de dieren te verwijderen voor mijnbouw. Jim ontdekt zijn plan en probeert het samen met Taylor te voorkomen.