Una joven agente del FBI debe vigilar a otro agente, pero ella se involucra en sus investigaciones de fenómenos paranormales e inexplicados.
Mulder y Scully descubren un vínculo escalofriante entre el encubrimiento de OVNIS y experimentos secretos del gobierno.
Gravemente herida en un extraño accidente, Olivia es perseguida por un ser metamórfico que está relacionado con los experimentos que Walter realizó años atrás.
Beth intenta recobrar la normalidad en la medida de lo posible pero su entorno y su propio cuerpo parecen empeñados en impedirselo. Al no poder enterrar a su hijo hasta que la policía haya atrapado al asesino, sigue estancada en las fases iniciales del duelo así que cuando aparece en su vida Raymond Connelly.
Con su compañera en coma en el hospital, Mulder recibe información clave de El Fumador que podría ser de vida o muerte para Scully.