Un an après la mystérieuse disparition d'Alison, ses quatre amies, Spencer, Aria, Hanna et Emily commencent à recevoir des messages et des menaces signés "A" concernant des secrets que seule Alison détenait et des circonstances de sa mort. Paniquées, les jeunes filles s'inquiètent et mènent leur propre enquête parallèlement à celle des policiers, mais bientôt, elles découvriront des choses qu'elles auraient préféré ne jamais découvrir.