John Savage

Un ouvrier travaillant à la construction d'une autoroute en Pennsylvanie est porté disparu après avoir été mystérieusement happé dans un tunnel rempli de restes humains.

Sonny s'expose à des actions disciplinaires; Clay considère un changement de parcours professionnel; Jason reçoit de la pression de la part du capitaine Lindell pour envisager la prochaine étape de sa carrière.

Après avoir été secourus, les rescapés d'un navire vieillissent et meurent rapidement; Mulder enquête et découvre que des expériences ont été effectuées sur le navire.

L'équipe traque le chef d'un nouveau groupe terroriste qui a orchestré la résistance violente lors des négociations de paix en Afghanistan; Clay apprend ce que signifie être un meneur; Sonny tente de réparer sa relation avec son père.

L'équipe débute son déploiement en Afghanistan au cours de négociations de paix; Sonny se rend au Texas pour entreprendre son entraînement disciplinaire et tombe sur Hannah, son amie d'enfance.

L'équipe est victime d'une embuscade lors d'une mission visant à extraire une information potentielle au sujet du nouveau leader d'un groupe terroriste; Sonny envisage de retourner vivre dans la ville où il a grandi.