MacGyver est un agent au sommet de la Fondation Phoenix, une agence progressive dévouée à la réparation des injustices de ce monde. Le génie MacGyver est encore plus progressiste, ne portant jamais d'arme et repoussant toujours l'ennemi grâce à ses vastes connaissances scientifiques. Parfois, il parvient à ses fins en utilisant autre chose que la pince à papier et le papier collant qu'il a dans ses poches.