L'agent Tom Keen se lance dans une nouvelle voie après qu'une mystérieuse rencontre avec le père qu'il n'a jamais connu l'amène à rejoindre Gray Matters, une organisation de sécurité internationale secrète dirigée par sa mère biologique, Scottie Hargrave. Tom forme une alliance fragile avec un groupe de mercenaires, et ensemble ils utilisent leurs compétences pour résoudre les problèmes les plus dangereux que le gouvernement ne touchera pas. Mais pour Tom, cette chance de rédemption n'est pas seulement pour rendre le monde plus sûr, car il entreprend également une mission pour découvrir la vérité de son propre passé trouble.