S3, E2: Flynn parte alla ricerca di Charlene. La squadra la rintraccia in Alberta in un laboratorio militare con un acceleratore di particelle. Jenkins ed Eve incontrano Apopi. Flynn, Stone e Cassandra riescono a sigillare il portale, non prima però che Anubi, evocato da Apopi, e tutti i lupi mannari siano risucchiati al suo interno. Flynn abbandona nuovamente la squadra per cercare la scomparsa Charlene.