S4, F16: Beckett und Castle sind auf der Jagd nach einem eiskalten und skrupellosen Mörder, der sich nicht mal aus der Ruhe bringen lässt, als sie ihn verhaften und einsperren. Während sie noch weiter nach belastenden Beweisen gegen Thomas Gage suchen, verschwindet nicht nur die Leiche seines Opfers aus der Gerichtsmedizin, sondern auch Gage selbst aus seiner Zelle. Kurz darauf werden Beckett und Castle am Fundort einer weiteren Leiche entführt und treffen in einem Geheimversteck der CIA auf die Agentin Sophia Turner, eine frühere Muse von Castle, der er in einem seiner Derrick-Storm-Bücher ausführlich gehuldigt hat. Beckett ist zwar alles andere als erfreut, macht aber gute Miene zu bösem Spiel, als Sophia sie und Castle über Gage aufklärt und die beiden mit ins Boot holt, um gemeinsam 'Pandora', ein von Gage geplantes Katastrophenszenario, zu verhindern. Nach ihrer Freilassung nerven Beckett und Castle zunächst mal Captain Gates und auch Ryan und Esposito mit der ihnen von Sophia auferlegten Geheimhaltung, aber dann gelingt es ihnen, den Wirtschaftsprofessor Blakely ausfindig zu machen, der nicht nur seinen Tod vorgetäuscht hat, um unterzutauchen, sondern auch über das Projekt 'Pandora' informiert ist. Bevor Blakely sein Wissen an Becket und Castle weitergeben kann, wird er vor ihren Augen ermordet und ein schwarzes SUV rammt Becketts Dienstwagen, der daraufhin mit ihnen an Bord im Hudson River versinkt.